小豆の品種には、ジーンバンク（遺伝資源の収集・保存施設）には、5000点以上の品種・在来種が保存されておりここでは触れることができない。現在、北海道で栽培されている小豆の品種は10品種あり、「サホロショウズ」「エリモショウズ」「アカネダイナゴン」「きたのおとめ」「しゅまり」「きたおとめ」 「ほくと大納言」がある。